线虫胚胎形成过程的早期阶段，是验证“系统水平”的方法在了解生物学过程方面与传统的、以各个酶为对象的还原方法相比所具有的潜力的一个理想系统。Gunsalus等人，通过将关于蛋白彼此之间如何发生相互作用、基因如何表达、以及“敲出”数百个基因所产生效应等方面的信息结合起来，建立了一系列关于在驱动早期胚胎形成过程中所涉及的分子机器的模型，并且能够提出这些机器之间的功能联系。他们发现，10种以前未定性的蛋白在这些系统中有重要作用，并且演示了这些系统何以能将信息反馈进单反应实验中。